Protein–RNA interactions for Protein: P08553

Nefm, Neurofilament medium polypeptide, mousemouse

Predictions only

Length 848 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NefmP08553 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
NefmP08553 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
NefmP08553 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NefmP08553 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NefmP08553 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NefmP08553 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NefmP08553 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NefmP08553 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NefmP08553 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NefmP08553 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NefmP08553 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NefmP08553 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NefmP08553 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NefmP08553 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NefmP08553 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NefmP08553 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NefmP08553 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
NefmP08553 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
NefmP08553 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NefmP08553 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NefmP08553 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
NefmP08553 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NefmP08553 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
NefmP08553 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
NefmP08553 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
NefmP08553 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefmP08553 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefmP08553 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefmP08553 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefmP08553 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
NefmP08553 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefmP08553 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefmP08553 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefmP08553 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefmP08553 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
NefmP08553 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
NefmP08553 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
NefmP08553 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms