Protein–RNA interactions for Protein: P07349

Ifna5, Interferon alpha-5, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifna5P07349 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Ifna5P07349 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Ifna5P07349 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms