Protein–RNA interactions for Protein: P07309

Ttr, Transthyretin, mousemouse

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Length 147 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtrP07309 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
TtrP07309 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
TtrP07309 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
TtrP07309 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtrP07309 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
TtrP07309 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
TtrP07309 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.19□□□□□ -0.14
TtrP07309 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.14
TtrP07309 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
TtrP07309 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
TtrP07309 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
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