Protein–RNA interactions for Protein: P06323

T-cell receptor alpha chain V region CTL-F3, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06323 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P06323 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P06323 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P06323 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P06323 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P06323 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P06323 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P06323 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms