Protein–RNA interactions for Protein: P01658

Ig kappa chain V-III region MOPC 321, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01658 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
P01658 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
P01658 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
P01658 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
P01658 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
P01658 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01658 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01658 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
P01658 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01658 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01658 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01658 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms