Protein–RNA interactions for Protein: O89023

Tpp1, Tripeptidyl-peptidase 1, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpp1O89023 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Tpp1O89023 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Tpp1O89023 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tpp1O89023 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tpp1O89023 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tpp1O89023 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tpp1O89023 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpp1O89023 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpp1O89023 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tpp1O89023 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tpp1O89023 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms