Protein–RNA interactions for Protein: O55101

Syngr2, Synaptogyrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr2O55101 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Syngr2O55101 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Syngr2O55101 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Syngr2O55101 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms