Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Prrt1O35449 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prrt1O35449 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prrt1O35449 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
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Prrt1O35449 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Prrt1O35449 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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