Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Xbp1O35426 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Xbp1O35426 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms