Protein–RNA interactions for Protein: O08585

Clta, Clathrin light chain A, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CltaO08585 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CltaO08585 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
CltaO08585 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CltaO08585 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CltaO08585 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CltaO08585 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CltaO08585 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CltaO08585 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CltaO08585 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.47
CltaO08585 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CltaO08585 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CltaO08585 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CltaO08585 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CltaO08585 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltaO08585 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CltaO08585 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CltaO08585 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms