Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ23

Gm21310, Predicted gene, 21310, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21310J3QQ23 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Gm21310J3QQ23 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Gm21310J3QQ23 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
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