Protein–RNA interactions for Protein: G3UY57

Trim15, Tripartite motif protein 15, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim15G3UY57 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Trim15G3UY57 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Trim15G3UY57 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.5 ms