Protein–RNA interactions for Protein: E9PYK3

Parp4, Poly [ADP-ribose] polymerase, mousemouse

Predictions only

Length 1,969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp4E9PYK3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Parp4E9PYK3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Parp4E9PYK3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Parp4E9PYK3 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms