Protein–RNA interactions for Protein: D6RJB6

USP17L20, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 20, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L20D6RJB6 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L20D6RJB6 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L20D6RJB6 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms