Protein–RNA interactions for Protein: D3Z4R4

Nkx6-2, NK6 homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 277 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx6-2D3Z4R4 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Nkx6-2D3Z4R4 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Nkx6-2D3Z4R4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms