Protein–RNA interactions for Protein: C9JLJ4

USP17L13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
USP17L13C9JLJ4 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
USP17L13C9JLJ4 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.2 ms