Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Cttnbp2B9EJA2 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC34.12■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Cttnbp2B9EJA2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC34.03■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.04
Cttnbp2B9EJA2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC34.01■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC34.01■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Cttnbp2B9EJA2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms