Protein–RNA interactions for Protein: B2RVB7

Hbb-bh2, Globin b2, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hbb-bh2B2RVB7 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Hbb-bh2B2RVB7 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Hbb-bh2B2RVB7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms