Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M2

Usp12, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 12, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp12Q9D9M2 Lig3-212ENSMUST00000173727 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.3□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pax6-225ENSMUST00000167211 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm26822-201ENSMUST00000181732 3374 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm43143-201ENSMUST00000196083 2023 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ticam1-201ENSMUST00000058136 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Armc2-201ENSMUST00000095729 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Kif3c-201ENSMUST00000020999 6791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 6430548M08Rik-203ENSMUST00000108950 3125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Nrbp2-201ENSMUST00000019516 2495 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 C130083M11Rik-201ENSMUST00000197171 2072 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm37447-201ENSMUST00000195625 2928 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ankrd46-201ENSMUST00000057486 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Csde1-207ENSMUST00000197827 2671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Skint7-202ENSMUST00000106568 1297 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Lime1-202ENSMUST00000108804 960 ntTSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm13700-201ENSMUST00000118624 1128 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6441-201ENSMUST00000120983 696 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ppt1-204ENSMUST00000121870 986 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mir1893-201ENSMUST00000122565 83 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm16305-201ENSMUST00000140747 556 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Hoxd3os1-203ENSMUST00000145799 511 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc1a3-208ENSMUST00000157065 728 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tex33-202ENSMUST00000165170 1072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tstd1-201ENSMUST00000171362 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6291-201ENSMUST00000179994 309 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm26906-201ENSMUST00000180523 1228 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm8601-201ENSMUST00000182096 909 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Marc1-203ENSMUST00000189492 1239 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm38349-201ENSMUST00000195732 462 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Zfp655-204ENSMUST00000199003 601 ntTSL 2 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Fgfbp1-203ENSMUST00000199894 1228 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tbc1d24-211ENSMUST00000201583 893 ntTSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm43811-201ENSMUST00000202862 695 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6794-201ENSMUST00000203829 457 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gpx4-ps2-201ENSMUST00000214811 555 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm18042-201ENSMUST00000219887 790 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC116797.2-202ENSMUST00000223587 1017 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ebi3-201ENSMUST00000003274 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 H2-Aa-201ENSMUST00000040655 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cstb-201ENSMUST00000005185 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Izumo1r-202ENSMUST00000069408 1172 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tex33-201ENSMUST00000074380 1147 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Hcst-201ENSMUST00000075062 442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Wfdc6a-201ENSMUST00000099096 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ctc1-202ENSMUST00000116359 3978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm11735-201ENSMUST00000106377 1581 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Nr1h4-203ENSMUST00000105297 2013 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6714-201ENSMUST00000218677 2330 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Stau2-202ENSMUST00000054668 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ccr6-205ENSMUST00000177568 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 2610028H24Rik-202ENSMUST00000105415 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tex45-201ENSMUST00000047265 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tcn2-206ENSMUST00000109992 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ptpre-205ENSMUST00000210833 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm32200-201ENSMUST00000192778 2385 ntTSL 1 (best) BASIC10.29□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ackr2-202ENSMUST00000214340 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm10827-201ENSMUST00000181897 2586 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Cct3-201ENSMUST00000001452 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Clu-201ENSMUST00000022616 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Eif2s3y-201ENSMUST00000091197 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Zfp330-201ENSMUST00000034147 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Dnmt3aos-201ENSMUST00000144896 1385 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Itgad-201ENSMUST00000033051 3965 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mdm4-206ENSMUST00000186617 4694 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ankub1-202ENSMUST00000197088 1854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC121870.2-201ENSMUST00000214343 1870 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mpp1-202ENSMUST00000114091 1558 ntTSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Ncmap-201ENSMUST00000064481 1448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6755-201ENSMUST00000100598 864 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm6740-201ENSMUST00000100617 864 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm24140-201ENSMUST00000122773 326 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm21958-201ENSMUST00000178832 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm4858-201ENSMUST00000179064 735 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7928-201ENSMUST00000181249 701 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm7445-201ENSMUST00000192115 340 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm37851-201ENSMUST00000193871 889 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm29808-201ENSMUST00000194419 468 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm31941-201ENSMUST00000209689 350 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC134537.1-201ENSMUST00000219205 265 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC122840.4-201ENSMUST00000221310 1285 ntTSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC134913.2-201ENSMUST00000225017 771 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 AC133499.1-201ENSMUST00000227778 1097 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Tex46-201ENSMUST00000046647 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Olfr1394-201ENSMUST00000052668 939 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm28635-201ENSMUST00000189772 4734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 March10-204ENSMUST00000138977 2979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 N6amt1-204ENSMUST00000120284 3473 ntTSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Usp12Q9D9M2 Myo18a-223ENSMUST00000169105 6475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.28□□□□□ -0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms