Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5Y9

SCN10A, Sodium channel protein type 10 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN10AQ9Y5Y9 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
SCN10AQ9Y5Y9 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PHPT1-201ENST00000247665 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SCN10AQ9Y5Y9 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms