Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVL1

Ap4s1, AP-4 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4s1Q9WVL1 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Ap4s1Q9WVL1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Ap4s1Q9WVL1 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ap4s1Q9WVL1 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1486.7 ms