Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTJ8

Fam50b, Protein FAM50B, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam50bQ9WTJ8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Fam50bQ9WTJ8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Fam50bQ9WTJ8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Fam50bQ9WTJ8 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms