Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0Q9

Mpdu1, Mannose-P-dolichol utilization defect 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mpdu1Q9R0Q9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Mpdu1Q9R0Q9 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Mpdu1Q9R0Q9 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mpdu1Q9R0Q9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms