Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUP7

TRMT13, tRNA:m(4)X modification enzyme TRM13 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 481 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT13Q9NUP7 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
TRMT13Q9NUP7 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRMT13Q9NUP7 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRMT13Q9NUP7 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms