Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ57

Kcnip1, Kv channel-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip1Q9JJ57 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Kcnip1Q9JJ57 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Kcnip1Q9JJ57 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms