Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN3

TMEM8A, Post-GPI attachment to proteins factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM8AQ9HCN3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
TMEM8AQ9HCN3 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
TMEM8AQ9HCN3 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
TMEM8AQ9HCN3 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms