Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCM2

PLXNA4, Plexin-A4, humanhuman

Predictions only

Length 1,894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLXNA4Q9HCM2 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
PLXNA4Q9HCM2 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.77■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.73■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
PLXNA4Q9HCM2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms