Protein–RNA interactions for Protein: Q9H4Q4

PRDM12, PR domain zinc finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM12Q9H4Q4 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PRDM12Q9H4Q4 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PRDM12Q9H4Q4 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PRDM12Q9H4Q4 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms