Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ripk4Q9ERK0 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ripk4Q9ERK0 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ripk4Q9ERK0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms