Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.53
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC30.78■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.52
Rpgrip1Q9EPQ2 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rpgrip1Q9EPQ2 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC30.7■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC30.7■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Rpgrip1Q9EPQ2 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms