Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Tspan4Q9DCK3 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tspan4Q9DCK3 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tspan4Q9DCK3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms