Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9T8

Efhc1, EF-hand domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 648 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efhc1Q9D9T8 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Efhc1Q9D9T8 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.71■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Efhc1Q9D9T8 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms