Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7V2

Lysmd2, LysM and putative peptidoglycan-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lysmd2Q9D7V2 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Lysmd2Q9D7V2 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Lysmd2Q9D7V2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms