Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J3

Ccdc94, Coiled-coil domain-containing protein 94, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc94Q9D6J3 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ccdc94Q9D6J3 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ccdc94Q9D6J3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ccdc94Q9D6J3 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms