Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

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Length 532 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
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Fam227bQ9D518 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Fam227bQ9D518 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Fam227bQ9D518 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
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Fam227bQ9D518 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
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Fam227bQ9D518 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Fam227bQ9D518 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
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