Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
H2al3Q9D4U4 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
H2al3Q9D4U4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms