Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C5

Eaf1, ELL-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eaf1Q9D4C5 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Eaf1Q9D4C5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Eaf1Q9D4C5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms