Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Tmem53Q9D0Z3 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Tmem53Q9D0Z3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms