Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZW4

Acsl3, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 720 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl3Q9CZW4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Acsl3Q9CZW4 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Acsl3Q9CZW4 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms