Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
ChtopQ9CY57 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ChtopQ9CY57 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
ChtopQ9CY57 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms