Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
PompQ9CQT5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PompQ9CQT5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PompQ9CQT5 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms