Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQD0

Rpl39l, RIKEN cDNA 4930517K11, mousemouse

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Length 51 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl39lQ9CQD0 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl39lQ9CQD0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl39lQ9CQD0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Rpl39lQ9CQD0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
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Rpl39lQ9CQD0 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl39lQ9CQD0 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
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Rpl39lQ9CQD0 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Rpl39lQ9CQD0 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
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