Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW85

CCDC94, Coiled-coil domain-containing protein 94, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC94Q9BW85 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AL137060.1-201ENST00000618151 2648 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
CCDC94Q9BW85 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SLC17A7-201ENST00000221485 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 BCS1L-210ENST00000431802 2015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CCDC94Q9BW85 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms