Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
TINF2Q9BSI4 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
TINF2Q9BSI4 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms