Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF3

Cep41, Centrosomal protein of 41 kDa, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cep41Q99NF3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cep41Q99NF3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cep41Q99NF3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms