Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SrrtQ99MR6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SrrtQ99MR6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SrrtQ99MR6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms