Protein–RNA interactions for Protein: Q99M01

Fars2, Phenylalanine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fars2Q99M01 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Fars2Q99M01 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Fars2Q99M01 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms