Protein–RNA interactions for Protein: Q91WQ9

Calml4, Calmodulin-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calml4Q91WQ9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Calml4Q91WQ9 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Calml4Q91WQ9 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms