Protein–RNA interactions for Protein: Q8K221

Arfip2, Arfaptin-2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip2Q8K221 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
Arfip2Q8K221 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Arfip2Q8K221 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms