Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZU6

Pxdc1, PX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pxdc1Q8JZU6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pxdc1Q8JZU6 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pxdc1Q8JZU6 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms